2009年度沈阳院科技奖励再次取得喜人业绩，共有十项科技成果获奖。其中，“百草枯催吐剂的研发应用” 荣获中国石油和化学工业协会科技进步一等奖，“农用杀菌剂烯肟菌胺创制及其产业化” 荣获辽宁省政府技术发明二等奖。另有“高品质氟代苯甲酰胺中间体的清洁生产技术”等七项科技成果获得中国石油和化学工业协会科技进步二等奖，一项染料国家标准的修订 获得中国石油和化学工业协会科技进步三等奖。
本年度获奖项目“百草枯催吐剂的研发应用”在沈阳院的生产企业—沈阳科创化学品有限公司实现工业化生产，目前国内市场占有率达到60%以上，取得了良好的应用效果。催吐剂的成功研发及广泛应用，打破了国际先进公司的技术垄断和产品垄断行为，满足了国际保护人权组织、世界卫生组织和我国政府的要求，满足了市场的迫切需要。同时该项目为生产企业和应用单位都创造了很好的经济效益和社会效益，有效的保障了人民群众的身心健康，符合国家绿色工艺、清洁生产、安全应用的先进标准。
沈阳院创制的农用杀菌剂烯肟菌胺2008年获得中国石油和化学工业协会科技奖励之后今年再次获得辽宁省政府奖励。一年来，沈阳院的科技人员与农业部农业技术推广中心联合、在扩大烯肟菌胺适用作物品种方面和增加推广使用面积方面做了大量工作，使烯肟菌胺成功用于多种蔬菜、水果、花卉、谷物及水稻上，加速了沈阳院创制品种的产业化和市场推广进程。
沈阳院同时获奖的其余八项科技成果分别为我国含氟精细化学品制备工艺创新、染料中间体技术更新换代、化工生产三废治理技术、国家农药和染料标准化等领域做出了突出贡献，取得了显著的经济效益和社会效益。